MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli E24377A plasmid pETEC_35

Total Repeats: 714

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009787	TCT	2	6	7	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009787	TTC	2	6	30	35	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009787	CAC	2	6	42	47	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_009787	CAG	2	6	81	86	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009787	GCA	2	6	157	162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_009787	CGG	2	6	211	216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_009787	CAG	2	6	252	257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_009787	GCA	2	6	296	301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_009787	GCC	2	6	318	323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_009787	TGC	2	6	343	348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009787	GCC	2	6	441	446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_009787	CGCT	2	8	475	482	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_009787	TCC	2	6	535	540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_009787	CGGT	2	8	649	656	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_009787	CTG	2	6	741	746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_009787	GA	3	6	749	754	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009787	GCA	2	6	755	760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_009787	TCA	2	6	839	844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009787	CGCA	2	8	882	889	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009787	ACGT	2	8	929	936	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009787	TCT	2	6	937	942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_009787	CTG	3	9	1032	1040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_009787	ATG	2	6	1084	1089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009787	CCT	2	6	1127	1132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_009787	TGC	2	6	1134	1139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_009787	CTG	2	6	1227	1232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_009787	ACCTG	2	10	1270	1279	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_009787	GAT	2	6	1281	1286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009787	CAC	2	6	1338	1343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_009787	TGT	2	6	1363	1368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009787	CCGC	2	8	1434	1441	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
32	NC_009787	GCA	2	6	1447	1452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_009787	CCA	2	6	1487	1492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_009787	TCA	2	6	1501	1506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_009787	GTT	2	6	1714	1719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009787	CGGT	2	8	1756	1763	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_009787	GAT	2	6	1881	1886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009787	GCT	2	6	1971	1976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009787	CAGC	2	8	2006	2013	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_009787	CAG	2	6	2040	2045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_009787	CTG	2	6	2073	2078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_009787	GC	3	6	2080	2085	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_009787	GCCT	2	8	2236	2243	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_009787	CAC	2	6	2273	2278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_009787	CGTG	2	8	2343	2350	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009787	CAC	2	6	2435	2440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_009787	TCT	2	6	2626	2631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009787	CAG	2	6	2634	2639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009787	TGG	2	6	2651	2656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009787	TCA	2	6	2687	2692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_009787	TCT	2	6	2696	2701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009787	TGA	2	6	2749	2754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009787	CA	3	6	2773	2778	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009787	ACG	2	6	2829	2834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_009787	TGC	3	9	2860	2868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009787	CCA	2	6	2891	2896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_009787	GAC	2	6	2911	2916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_009787	CTT	2	6	3029	3034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_009787	GCA	3	9	3122	3130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009787	GCA	2	6	3280	3285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_009787	CAT	2	6	3318	3323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_009787	GC	3	6	3356	3361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_009787	AGC	2	6	3463	3468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009787	GC	3	6	3492	3497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_009787	TTCA	2	8	3516	3523	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_009787	CG	3	6	3833	3838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_009787	GCC	2	6	3887	3892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_009787	CAG	2	6	3909	3914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009787	CGG	2	6	3992	3997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_009787	A	6	6	4025	4030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009787	TGG	2	6	4151	4156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009787	TCA	2	6	4219	4224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009787	CCA	2	6	4307	4312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_009787	GC	4	8	4356	4363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_009787	CCT	2	6	4379	4384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_009787	CAC	2	6	4389	4394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_009787	GA	3	6	4528	4533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009787	GTA	2	6	4656	4661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009787	GTA	2	6	4677	4682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009787	GAA	2	6	4702	4707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009787	GTC	2	6	4733	4738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149405
82	NC_009787	TGAT	2	8	4767	4774	25 %	50 %	25 %	0 %	157149405
83	NC_009787	CCA	2	6	4849	4854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149405
84	NC_009787	GGA	2	6	4878	4883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149405
85	NC_009787	TCC	2	6	4922	4927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157149405
86	NC_009787	GGTGGA	2	12	4928	4939	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	157149405
87	NC_009787	CAG	2	6	4957	4962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149405
88	NC_009787	TCTG	2	8	5004	5011	0 %	50 %	25 %	25 %	157149405
89	NC_009787	AGG	2	6	5027	5032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149405
90	NC_009787	CAG	2	6	5053	5058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149405
91	NC_009787	CAG	2	6	5068	5073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149405
92	NC_009787	AGG	2	6	5075	5080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149405
93	NC_009787	ACG	2	6	5122	5127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149405
94	NC_009787	CT	3	6	5157	5162	0 %	50 %	0 %	50 %	157149405
95	NC_009787	CAA	2	6	5225	5230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149405
96	NC_009787	CAC	2	6	5279	5284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149405
97	NC_009787	TTC	3	9	5366	5374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149405
98	NC_009787	T	7	7	5435	5441	0 %	100 %	0 %	0 %	157149405
99	NC_009787	TCC	2	6	5463	5468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157149405
100	NC_009787	GAA	3	9	5501	5509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149405
101	NC_009787	CAG	2	6	5519	5524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149405
102	NC_009787	GCC	3	9	5535	5543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149405
103	NC_009787	TTC	2	6	5561	5566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149405
104	NC_009787	GCC	2	6	5603	5608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149405
105	NC_009787	AAT	2	6	5627	5632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149405
106	NC_009787	AAG	2	6	5659	5664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149405
107	NC_009787	A	7	7	5677	5683	100 %	0 %	0 %	0 %	157149405
108	NC_009787	CAG	2	6	5717	5722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149405
109	NC_009787	TGG	2	6	5725	5730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149405
110	NC_009787	TCG	2	6	5784	5789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149405
111	NC_009787	TAA	2	6	5794	5799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149405
112	NC_009787	AGCC	2	8	5802	5809	25 %	0 %	25 %	50 %	157149405
113	NC_009787	TAGT	2	8	5910	5917	25 %	50 %	25 %	0 %	157149405
114	NC_009787	TCT	2	6	5944	5949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149405
115	NC_009787	CAG	2	6	6023	6028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149405
116	NC_009787	CTGCC	2	10	6108	6117	0 %	20 %	20 %	60 %	157149405
117	NC_009787	CAC	2	6	6130	6135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149405
118	NC_009787	C	6	6	6310	6315	0 %	0 %	0 %	100 %	157149405
119	NC_009787	T	6	6	6455	6460	0 %	100 %	0 %	0 %	157149405
120	NC_009787	CAT	2	6	6461	6466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149405
121	NC_009787	GAT	2	6	6509	6514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149405
122	NC_009787	CTG	2	6	6527	6532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149405
123	NC_009787	AGC	2	6	6588	6593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149405
124	NC_009787	GCG	2	6	6594	6599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149405
125	NC_009787	AAT	2	6	6608	6613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149405
126	NC_009787	ATC	2	6	6653	6658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149405
127	NC_009787	TAA	2	6	6699	6704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149405
128	NC_009787	T	6	6	6733	6738	0 %	100 %	0 %	0 %	157149405
129	NC_009787	ATC	2	6	6753	6758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149405
130	NC_009787	ATA	2	6	6774	6779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149405
131	NC_009787	CAG	2	6	6812	6817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149405
132	NC_009787	TAA	2	6	6855	6860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149405
133	NC_009787	ATT	2	6	6869	6874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149405
134	NC_009787	ATA	2	6	6948	6953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149405
135	NC_009787	AAT	2	6	6964	6969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009787	AGAA	2	8	6988	6995	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009787	AATAA	2	10	7037	7046	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009787	CTT	2	6	7146	7151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149414
139	NC_009787	TTA	2	6	7169	7174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149414
140	NC_009787	T	6	6	7299	7304	0 %	100 %	0 %	0 %	157149414
141	NC_009787	GCA	2	6	7382	7387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149414
142	NC_009787	CGC	2	6	7450	7455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149414
143	NC_009787	TGTTT	2	10	7818	7827	0 %	80 %	20 %	0 %	157149414
144	NC_009787	TGC	2	6	7879	7884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_009787	TCC	2	6	7891	7896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_009787	ACT	2	6	8040	8045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_009787	CAT	3	9	8073	8081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_009787	C	7	7	8124	8130	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
149	NC_009787	CAAC	2	8	8174	8181	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_009787	TCA	2	6	8263	8268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_009787	ATC	2	6	8281	8286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_009787	ATA	2	6	8308	8313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_009787	GAA	2	6	8327	8332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_009787	A	6	6	8344	8349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_009787	ATAAA	2	10	8353	8362	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_009787	CTC	2	6	8394	8399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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159	NC_009787	A	6	6	8430	8435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_009787	TAC	2	6	8439	8444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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162	NC_009787	ATC	2	6	8520	8525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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164	NC_009787	ATC	2	6	8553	8558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_009787	GTT	2	6	8560	8565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_009787	ATC	2	6	8602	8607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149422
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172	NC_009787	T	7	7	8782	8788	0 %	100 %	0 %	0 %	157149422
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261	NC_009787	T	6	6	13015	13020	0 %	100 %	0 %	0 %	157149423
262	NC_009787	CTG	2	6	13074	13079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149423
263	NC_009787	T	7	7	13183	13189	0 %	100 %	0 %	0 %	157149423
264	NC_009787	ACG	2	6	13193	13198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149423
265	NC_009787	ACG	2	6	13328	13333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149423
266	NC_009787	GCG	2	6	13337	13342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149423
267	NC_009787	CGGG	2	8	13375	13382	0 %	0 %	75 %	25 %	157149423
268	NC_009787	ATC	2	6	13383	13388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149423
269	NC_009787	TCA	2	6	13407	13412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149423
270	NC_009787	TC	3	6	13513	13518	0 %	50 %	0 %	50 %	157149423
271	NC_009787	GA	3	6	13527	13532	50 %	0 %	50 %	0 %	157149423
272	NC_009787	CAT	2	6	13606	13611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149423
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404	NC_009787	CAG	2	6	19501	19506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149410
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